More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2642 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  41.99 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  36.13 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  34.63 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.73 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  35.12 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  38.21 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  35.47 
 
 		 371 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  33.18 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  38 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  36.36 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  33.8 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  37.62 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  35.24 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  35.24 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  36.67 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  35.86 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  32.88 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  32.71 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  35.21 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  33.64 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.95 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  41.26 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.92 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  33.97 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.82 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  31.07 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  35.68 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  31.4 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  31.61 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  29.86 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  32.34 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  31.65 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  34.26 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.19 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  33.01 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  32.54 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  30.99 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  35.71 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  28.1 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  45.05 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  36.6 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  28.77 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  35.21 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  32.43 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.92 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  33.96 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  27.91 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  31.1 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  32.74 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  32.71 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.28 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.77 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  30.24 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  29.44 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  31.91 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.82 
 
 		 365 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  28.92 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  28.97 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.04 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  26.57 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  28.43 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  30.46 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  25.71 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  32.9 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  25.11 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.43 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  30.19 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  28.18 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  28.64 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  28.24 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  30.6 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  34.01 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  29.17 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  29.66 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  28.27 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  30.39 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  26.07 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  27.19 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  27.19 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  24.42 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  27.23 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  27.22 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  25.56 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  34.18 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  28.05 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  27.15 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  26.98 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  28.14 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  32.41 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  24 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  31.03 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>