More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4045 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  59.91 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  60.47 
 
 
221 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  58.69 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  48.4 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  50.95 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  36.15 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  33.94 
 
 
217 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.14 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  31.14 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  30.23 
 
 
269 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  35.19 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  31.22 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  40.58 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  30.7 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  28.04 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  29.2 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  30.84 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  29.22 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  27.73 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  35.37 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  29.44 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  30.45 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  31.68 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  30.88 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  34.69 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.39 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  31.25 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  31.8 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  31.96 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  28.57 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  31.37 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  30.36 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  25.34 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  25.71 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.98 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  28.63 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  34.59 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  35.14 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  27.19 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  29.73 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  30.49 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.82 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  28.32 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  32.1 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  28.44 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  27.6 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  28.57 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  29.05 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  30.88 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  25.69 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  28.77 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  29.58 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  30 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.09 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  26.34 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  28.12 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  26.44 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  30.27 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  31.79 
 
 
174 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  29.95 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  27.7 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  32.46 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  33.56 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  23.94 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  26.75 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1852  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  34.78 
 
 
258 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  30.61 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  29.33 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  39.18 
 
 
181 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  27.65 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.64 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1750  hexapaptide repeat-containing transferase  34.59 
 
 
182 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410351  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  30.22 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1518  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.78 
 
 
260 aa  61.6  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1896  acetyltransferase  28.87 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  31.16 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  24.88 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.37 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  27.8 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  30.95 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  27.8 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  35.37 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  25.97 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.73 
 
 
365 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  29.53 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.76 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  31.62 
 
 
312 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  26.92 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  27.4 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1362  hexapaptide repeat-containing transferase  31.11 
 
 
156 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1392  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  37.07 
 
 
265 aa  58.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.266052  normal  0.0129278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  26.17 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.66 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  28.06 
 
 
317 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  32.43 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3214  transferase, putative  29.71 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>