More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1269 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  100 
 
 
296 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  67.76 
 
 
269 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  35.43 
 
 
223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  34.58 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  38.71 
 
 
216 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  36.32 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  40.91 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  33.18 
 
 
211 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  38.89 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 
226 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  36.77 
 
 
217 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  37.85 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  36.45 
 
 
218 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  34.56 
 
 
221 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  38.5 
 
 
215 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  38.53 
 
 
212 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  37.1 
 
 
225 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  36.79 
 
 
227 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  30.94 
 
 
209 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  34.42 
 
 
210 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  27.65 
 
 
213 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  35 
 
 
222 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  32.71 
 
 
212 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  33.47 
 
 
216 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  36.54 
 
 
222 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  39.44 
 
 
206 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  33.03 
 
 
213 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.91 
 
 
365 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  37.16 
 
 
213 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.59 
 
 
197 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  29.58 
 
 
194 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.57 
 
 
218 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  30.81 
 
 
212 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  32.74 
 
 
220 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  22.37 
 
 
226 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  35.42 
 
 
174 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  37.56 
 
 
221 aa  89  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  25.34 
 
 
210 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  29.52 
 
 
195 aa  86.7  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 
227 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 
220 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  30.14 
 
 
192 aa  85.9  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  33.52 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  27.88 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  31.31 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  32.39 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.01 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  34.8 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  31.25 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  39.06 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  27.31 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  37.39 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  31.37 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  28.91 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  34.58 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  28.91 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  31.46 
 
 
216 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.56 
 
 
220 aa  79  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  30.88 
 
 
210 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  26.03 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  26.48 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  27.67 
 
 
217 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  26.05 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  33.64 
 
 
213 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  25.23 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  29.17 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  24.55 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  41.18 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  38.25 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.55 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  26.21 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  27.05 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  26.21 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  30.77 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  26.58 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  27.78 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  25.34 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.49 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  29.77 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  28.91 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.48 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  40.5 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  23.19 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  29.82 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  29.81 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.01 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  25.82 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  30 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  21.8 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  21.8 
 
 
203 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  23.83 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  21.61 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  26.89 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.05 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  32.98 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  31.25 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  41.46 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>