More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2725 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  100 
 
 		 181 aa  361  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  50 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  40.57 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  38.29 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  43.12 
 
 		 211 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  36.31 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  37.82 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  45.3 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  43.58 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  41.01 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  45.39 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  39.69 
 
 		 371 aa  94  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  43.57 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  40.29 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  37.68 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  33.52 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  37.24 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  37.27 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  34.09 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  31.51 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.18 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  36.55 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  35.92 
 
 		 226 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  36.84 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  33.09 
 
 		 209 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  32.89 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  40.44 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  35.22 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.51 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  36.17 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  31.94 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  43.1 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  36.2 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  33.33 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  31.94 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  31.94 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.07 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  31.11 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  34.03 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  37.41 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.54 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.51 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  35.19 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  31.85 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  36.13 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.72 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  33.13 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.67 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  36.11 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  34.92 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  37.93 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.94 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  35.12 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  35.81 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.67 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  37.42 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  33.57 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  32.64 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  31.67 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  31.67 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  29.61 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  41.11 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  27.14 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  28.67 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  33.52 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  28.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  34.36 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  30 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  32.96 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  31.67 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  30.17 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  31.94 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  37.5 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  30.71 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  26.06 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  34 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.62 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  39.18 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  25.9 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  34.23 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  28.26 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  31.67 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  37.61 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  34.21 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  32 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  29.61 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  26.49 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  32.17 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>