240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2641 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  37.99 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  31.7 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  34.93 
 
 
215 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  35.87 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  28.84 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.18 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  34.7 
 
 
215 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  28.04 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  32.08 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  31.44 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  31.05 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.09 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  32.39 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.31 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  31.84 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  31.44 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  34 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  29.86 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  29.3 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  27.44 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  28.51 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  32.84 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  27.4 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  29.86 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  36 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  29.66 
 
 
296 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  29.91 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  34.27 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  29.63 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  28.07 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  30.38 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  35.81 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  29.33 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  26.85 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  29.33 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  29.44 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  30.58 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  31.02 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  28.51 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  27.15 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  29.91 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  30.38 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  30.59 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  29.46 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  33.59 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  29.28 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  27.83 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  34.85 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  31.08 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  29.28 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  25.47 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  25.47 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  28 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  25.12 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.03 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  24.64 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  27.16 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  28.7 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  24.09 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  27.88 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.4 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  30.68 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.25 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  27.98 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  32.18 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  29.41 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  24.09 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  33.11 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  31.07 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  31.07 
 
 
190 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  32.62 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  22.83 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  24.43 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  24.53 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.96 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  24.22 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.51 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0192  transferase, putative  29.2 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0496333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  26.79 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  24.42 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  32.73 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  29.63 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  29.91 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  27.93 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  24.24 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0194  hypothetical protein  27.43 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  31.98 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  25 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  22.62 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>