More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02341 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  67.43 
 
 
221 aa  308  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  70.09 
 
 
220 aa  304  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  54.63 
 
 
219 aa  246  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  58.82 
 
 
222 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  52.58 
 
 
217 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  33.64 
 
 
217 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  32.08 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  34.7 
 
 
216 aa  92  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  45.45 
 
 
269 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  33.18 
 
 
213 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  30.94 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  28.05 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  31.28 
 
 
195 aa  85.1  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  38.5 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  32.38 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.36 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  32.73 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  27.62 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  42.02 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  33.49 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  32.87 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  33.95 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  30.29 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  25 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.43 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  27.1 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  26.05 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  34 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  31.75 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.63 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  42.45 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  28.5 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  33.18 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  33.18 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  27.49 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  29.49 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  32.29 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  39.5 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  38.79 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  41.03 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  35.81 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  29.89 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  28.71 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  33.11 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  30.88 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  32.41 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  26.19 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  34.53 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  26.19 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  28.23 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.24 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  28.97 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.8 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  28.65 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.22 
 
 
365 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  27.01 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  36.97 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  32.65 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  29.65 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1852  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  37.07 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1518  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  31.9 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  30.17 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  25.24 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  37.96 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  37.27 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  29.25 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  33.33 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  23.08 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  35.46 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  33.09 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  36.04 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  28.8 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2444  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  35.9 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00303767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  37.62 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  36.3 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  28.8 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.3 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1750  hexapaptide repeat-containing transferase  34.45 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410351  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  26.17 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1185  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosa mineO-acyltransferase  39.45 
 
 
253 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1456  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  35.96 
 
 
258 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  25.46 
 
 
210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  28.38 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.1 
 
 
249 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  33.11 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  31.03 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  35.29 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  28.11 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  35.65 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  34.88 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  56.36 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  38.02 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  36.3 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  27.52 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  34.72 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1172  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.21 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206007  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  42.02 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1456  acyl-(acyl-carrier-protein)-UDP-N- acetylglucosamine acyltransferase  34.21 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.844517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>