More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3476 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  67.76 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  34.51 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  37.85 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  37.85 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  38.32 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  36.32 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  33.02 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  38.81 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  33.18 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  34.05 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  37.5 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  35.21 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  34.88 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  33.18 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  37.16 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  32.72 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  37.09 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  37.39 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  30.52 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 227 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  38.81 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  33.8 
 
 		 211 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  25.93 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  27.98 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  34.72 
 
 		 210 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.45 
 
 		 196 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  35.16 
 
 		 209 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  32.42 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  32.71 
 
 		 218 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  36.7 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  33.49 
 
 		 217 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.49 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  30.95 
 
 		 195 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  32.24 
 
 		 194 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  33.03 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  36.82 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  30.77 
 
 		 212 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.88 
 
 		 220 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 		 174 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  36.44 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.49 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  31.94 
 
 		 192 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  35.98 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  29.25 
 
 		 212 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  43.7 
 
 		 218 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  33.11 
 
 		 222 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  25.84 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.67 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  29.58 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  31.19 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  29.36 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  36.28 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  29.63 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.96 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  43.1 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.55 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  26.55 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  26.55 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  28.64 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  30.77 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  32.87 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  31.78 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  26.46 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  25.57 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.25 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  34.1 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  30.37 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  28.57 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  29.05 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  29.38 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  34.03 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  27.27 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  30.09 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  31.98 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  33.18 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  33.15 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  33.15 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  28.24 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  33.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  33.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  33.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  33.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  33.15 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  26.58 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  28.84 
 
 		 216 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  31.84 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  27.91 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  29.79 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  30.34 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  26.73 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  23.58 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.01 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  28.3 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  38.58 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  27.88 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  22.22 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  29.63 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  22.22 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  27.8 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>