More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3101 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  72.33 
 
 		 212 aa  314  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  50 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  53 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  50.49 
 
 		 214 aa  204  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  50.49 
 
 		 214 aa  204  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  40.1 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  40.1 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  34.02 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  38 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  31.79 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  33.84 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 		 371 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  32.68 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  32.84 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  34.9 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  32.52 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.54 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  31.71 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  35.19 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  30.24 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.65 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  29.26 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  27.8 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  31.1 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  35.47 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  30.1 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.35 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  25.77 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  37.5 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  36.59 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  28.64 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  32.56 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  27.59 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  30.3 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.03 
 
 		 365 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  33 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  30.14 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  29.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.46 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  28.12 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  27.59 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  26.83 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  28.79 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  25.94 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.6 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  24 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  30.22 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  26.96 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  30.56 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  30.43 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  27.27 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  26.57 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  28.29 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  27.14 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  36.84 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  37.29 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  26.42 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  28.95 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  23.66 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  28.57 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  35.54 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  34.31 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  32.38 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  26.14 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  28.89 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  32.82 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  30.82 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  33.05 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.29 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  26.53 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  28.26 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  28.85 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2976  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  33.05 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  26.35 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  26.88 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  29.23 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  23.53 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  26.72 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1764  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylateN- ac etyltransferase  29.66 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0613  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  32.23 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  26.09 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  26.09 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  26.92 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  42.11 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0074  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  32.28 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  26.92 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.66 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  30.51 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28150  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0233696  normal  0.996095 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0772  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  31.52 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0296954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  25.32 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  26.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  26.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  26.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  24.83 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>