More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3749 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3749  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
218 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  63.81 
 
 
218 aa  291  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2575  transferase, putative  61.9 
 
 
217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211269  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0320  Acyl-(acyl carrier protein)-like protein  57.67 
 
 
217 aa  265  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3214  transferase, putative  54.79 
 
 
219 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  46.31 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  48.51 
 
 
221 aa  194  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  41.2 
 
 
223 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2311  hexapaptide repeat-containing transferase  44.24 
 
 
225 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0450903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2356  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  42.27 
 
 
242 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0707  hypothetical protein  40.59 
 
 
222 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.727411  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  38.35 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  38.39 
 
 
219 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  38.21 
 
 
224 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3842  hypothetical protein  32.04 
 
 
111 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0203938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  26.32 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  25 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  26.04 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  30.07 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  34.62 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  30.28 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  25.28 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4676  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.91 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  21.43 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5141  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.91 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.096531  normal  0.0226527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  23.72 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2585  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  31.03 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.09242  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3436  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.81 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.632888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  24.77 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  22.4 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.49 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  26.81 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  29.85 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  28.79 
 
 
240 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  25.86 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  24.44 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0397  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  24.16 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  23.88 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1528  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.81 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.482042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  26.15 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1036  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.59 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0630219  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  25.41 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0643  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  28.85 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1442  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.78 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  23.88 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  29.6 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0573  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  22.53 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0549  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  22.53 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  24.7 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  28.15 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1171  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.48 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.407969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5218  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  27.78 
 
 
268 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0163  putative acetyl transferase  29.37 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3184  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.91 
 
 
266 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165839  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  26.43 
 
 
251 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  25 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  24.62 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.3 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.37 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3249  acetyltransferase  29.41 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  24.85 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  21.65 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  23.27 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  30.63 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  22.96 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  29.2 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  30.63 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4428  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  29.09 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.0483089 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  27.91 
 
 
365 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  34.48 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  35.42 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  32.23 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38870  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  31.82 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  32.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  24.26 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  22.56 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  27.78 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  27.1 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0180  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  31.53 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.202213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4554  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  28.97 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233957  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  23.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0613  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  25.76 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  36.21 
 
 
231 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1495  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  30.91 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17210  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  30.91 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  24.42 
 
 
227 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1163  acetyltransferase  32.61 
 
 
204 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  26.71 
 
 
221 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  27.88 
 
 
286 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1185  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosa mineO-acyltransferase  29.41 
 
 
253 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  22.29 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  23.7 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  26.98 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0288  hypothetical protein  23.16 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.038909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  27.36 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  28.68 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  23.67 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  25 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  23.87 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>