158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2245 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  42.86 
 
 
197 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  44.19 
 
 
190 aa  147  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  38.71 
 
 
195 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  34.64 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  33.71 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 
223 aa  97.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  39.31 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  33.7 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  31.51 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  34.97 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  32.05 
 
 
212 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  35 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  37.29 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  32.77 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  37.8 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  35.19 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.67 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  35.81 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  32.92 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  34.27 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  33.71 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  28.57 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  29.05 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.15 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  30.59 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  28.1 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  32.72 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  30.81 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.18 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  33.33 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.85 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  35.2 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.58 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  24.44 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  25.39 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  27.56 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  26.74 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  29.07 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.13 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  29.14 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  30.43 
 
 
217 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  31.82 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.52 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  27.43 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  32.03 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  31.63 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.81 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  29.94 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  25.68 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  28.89 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  28.81 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  29.89 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  25.45 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  32.32 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.57 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  30.11 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  26.95 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  23.94 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  31.61 
 
 
296 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.32 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  33.33 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  26.74 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  27.08 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  30.29 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  29.26 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  25 
 
 
223 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  25.56 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  25.51 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  28.98 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  26.88 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  24.32 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  30.84 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  24.58 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  30.11 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  28.42 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  24.44 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  23.86 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  25.64 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  26.35 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  26.63 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  23.89 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.69 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0074  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  26.22 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  28.98 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  28.57 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  25.68 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2165  putative 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  29.46 
 
 
236 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000696509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1876  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase, putative  29.46 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000883731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  25.73 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1413  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  38.1 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0200133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>