38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2449 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  89.09 
 
 		 834 aa  1446    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  47.85 
 
 		 850 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  47.08 
 
 		 883 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1623    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  88.85 
 
 		 834 aa  1422    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  47.04 
 
 		 834 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  50.39 
 
 		 894 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  31.95 
 
 		 888 aa  313  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  34.8 
 
 		 851 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  34.8 
 
 		 846 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  32.02 
 
 		 832 aa  301  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  34.38 
 
 		 850 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  30.53 
 
 		 881 aa  287  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  34.11 
 
 		 844 aa  283  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  33.22 
 
 		 828 aa  279  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  30 
 
 		 881 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  30.06 
 
 		 897 aa  273  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  33.22 
 
 		 850 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  33.06 
 
 		 873 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  30.14 
 
 		 884 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  30.65 
 
 		 884 aa  251  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  29.57 
 
 		 909 aa  250  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  31.96 
 
 		 862 aa  249  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  30.21 
 
 		 897 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  36.05 
 
 		 879 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  31.97 
 
 		 878 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  28.55 
 
 		 805 aa  242  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  29.87 
 
 		 859 aa  239  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  28.9 
 
 		 914 aa  228  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  30.37 
 
 		 867 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  31.67 
 
 		 866 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  31.67 
 
 		 910 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  31.81 
 
 		 908 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  31.89 
 
 		 914 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  29.27 
 
 		 904 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  26.54 
 
 		 963 aa  141  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  24.69 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.04 
 
 		 840 aa  48.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>