39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1680 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  61.16 
 
 		 910 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  61.67 
 
 		 914 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  85.73 
 
 		 878 aa  1243    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  59.19 
 
 		 879 aa  886    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  61.01 
 
 		 908 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  45.51 
 
 		 909 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  44.08 
 
 		 859 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  42.63 
 
 		 851 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  39.92 
 
 		 888 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  41.48 
 
 		 846 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  41.12 
 
 		 850 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  41.57 
 
 		 844 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  41.08 
 
 		 828 aa  486  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  41.16 
 
 		 850 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  39.55 
 
 		 866 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  36.45 
 
 		 881 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  36.57 
 
 		 881 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  36.37 
 
 		 862 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  35.68 
 
 		 897 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  34.46 
 
 		 832 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  35.37 
 
 		 897 aa  363  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.09 
 
 		 884 aa  353  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 884 aa  342  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  32.92 
 
 		 914 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  28.9 
 
 		 805 aa  317  7e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  34 
 
 		 834 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  34.19 
 
 		 834 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 830 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  32.4 
 
 		 850 aa  281  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  33.76 
 
 		 883 aa  267  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  32.39 
 
 		 834 aa  247  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  30.8 
 
 		 867 aa  233  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  34.34 
 
 		 894 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  30.09 
 
 		 963 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  31.98 
 
 		 904 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.46 
 
 		 767 aa  153  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1005  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1111 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.69 
 
 		 2851 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>