41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1817 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  99.41 
 
 		 908 aa  1253    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  64 
 
 		 879 aa  978    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  59.28 
 
 		 873 aa  895    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 910 aa  1786    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  59.72 
 
 		 878 aa  872    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  86.8 
 
 		 914 aa  1281    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  44.06 
 
 		 909 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  41.79 
 
 		 859 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  42.57 
 
 		 851 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  40.43 
 
 		 888 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  42.48 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  41.75 
 
 		 850 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  41.52 
 
 		 844 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  40.97 
 
 		 850 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  40.4 
 
 		 828 aa  459  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  35.13 
 
 		 881 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  35.13 
 
 		 881 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  34.59 
 
 		 897 aa  389  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  39.35 
 
 		 866 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  34.55 
 
 		 862 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  35.21 
 
 		 897 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.93 
 
 		 884 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  32.17 
 
 		 832 aa  352  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  33.59 
 
 		 884 aa  347  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  32.25 
 
 		 914 aa  330  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  32.91 
 
 		 834 aa  293  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  32.91 
 
 		 834 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  31.41 
 
 		 830 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  31.13 
 
 		 850 aa  268  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  26.83 
 
 		 805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  30.85 
 
 		 883 aa  238  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  31.01 
 
 		 867 aa  233  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  29.94 
 
 		 894 aa  201  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  29.56 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.1 
 
 		 904 aa  181  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  29.17 
 
 		 963 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  23.9 
 
 		 767 aa  99  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  23.53 
 
 		 2993 aa  45.8  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1005  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1111 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.04 
 
 		 3242 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>