37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1706 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  59.96 
 
 		 873 aa  894    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  90.12 
 
 		 910 aa  1134    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  89.97 
 
 		 908 aa  1130    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  64.19 
 
 		 879 aa  980    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 914 aa  1779    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  60.02 
 
 		 878 aa  869    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  44.24 
 
 		 909 aa  588  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  42.1 
 
 		 859 aa  559  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  40.71 
 
 		 888 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  41.1 
 
 		 851 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  40.71 
 
 		 850 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  41.23 
 
 		 846 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  41.17 
 
 		 844 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  40.86 
 
 		 850 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  39.54 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  35.16 
 
 		 881 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  35.16 
 
 		 881 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  34.48 
 
 		 897 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  39.41 
 
 		 866 aa  376  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  35.1 
 
 		 897 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.93 
 
 		 884 aa  364  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  32.21 
 
 		 832 aa  344  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  33.95 
 
 		 884 aa  340  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  32.97 
 
 		 914 aa  332  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  34.74 
 
 		 862 aa  319  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  33 
 
 		 834 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  27.59 
 
 		 805 aa  290  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  32.49 
 
 		 834 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  32.29 
 
 		 830 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  31.26 
 
 		 850 aa  267  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  30.31 
 
 		 867 aa  229  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  31.16 
 
 		 883 aa  224  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  29.64 
 
 		 904 aa  197  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  29.37 
 
 		 834 aa  194  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  28.83 
 
 		 963 aa  190  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  31.04 
 
 		 894 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  24.51 
 
 		 767 aa  90.9  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>