37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0940 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  68.77 
 
 		 828 aa  1069    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  88.84 
 
 		 846 aa  1384    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  79.44 
 
 		 850 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  77.27 
 
 		 850 aa  1210    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  71.36 
 
 		 844 aa  1124    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  47.47 
 
 		 866 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  66.41 
 
 		 888 aa  1110    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  41.49 
 
 		 873 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  41.32 
 
 		 859 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  40.31 
 
 		 909 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  41.07 
 
 		 878 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  37.31 
 
 		 881 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  38.07 
 
 		 862 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  37.31 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  36.94 
 
 		 897 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  37.14 
 
 		 884 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  36.57 
 
 		 884 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  35.71 
 
 		 897 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  43.32 
 
 		 908 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  43.32 
 
 		 910 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  39.67 
 
 		 879 aa  412  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  35.99 
 
 		 832 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  42.24 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  31.72 
 
 		 805 aa  396  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  32.67 
 
 		 914 aa  356  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  34.71 
 
 		 830 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  34.36 
 
 		 834 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  34.64 
 
 		 834 aa  331  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  32.88 
 
 		 850 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  32.84 
 
 		 883 aa  289  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  32.03 
 
 		 867 aa  283  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  32.04 
 
 		 834 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  32.4 
 
 		 894 aa  223  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.64 
 
 		 904 aa  180  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  29.1 
 
 		 963 aa  151  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.35 
 
 		 767 aa  125  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>