37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2385 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  98.92 
 
 		 834 aa  1619    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  49.3 
 
 		 850 aa  692    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  47.79 
 
 		 883 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  88.85 
 
 		 830 aa  1446    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1633    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  45.47 
 
 		 834 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  50.08 
 
 		 894 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  32.01 
 
 		 888 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  32.7 
 
 		 832 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  34.31 
 
 		 846 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  33.94 
 
 		 851 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  35.01 
 
 		 850 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  31.05 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  31.88 
 
 		 862 aa  295  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  31.05 
 
 		 881 aa  291  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  31.13 
 
 		 897 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  34.15 
 
 		 844 aa  280  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  32.68 
 
 		 879 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  33.49 
 
 		 873 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  33.72 
 
 		 828 aa  270  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  30.5 
 
 		 909 aa  266  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  32.59 
 
 		 850 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  31.08 
 
 		 884 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  31.2 
 
 		 897 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  30.62 
 
 		 884 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  28.25 
 
 		 805 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  31.72 
 
 		 878 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  30.44 
 
 		 859 aa  244  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  29.3 
 
 		 914 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  29.5 
 
 		 867 aa  222  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  32.29 
 
 		 910 aa  210  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  31.08 
 
 		 866 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  32.05 
 
 		 908 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  32.84 
 
 		 914 aa  205  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.9 
 
 		 904 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  25.47 
 
 		 963 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  25.7 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>