37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0573 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  100 
 
 
828 aa  1632    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  69.06 
 
 
846 aa  1057    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  67.1 
 
 
850 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  69.69 
 
 
850 aa  1071    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  68.77 
 
 
851 aa  1072    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  81.37 
 
 
844 aa  1240    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  63.48 
 
 
888 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  45.83 
 
 
866 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  40.79 
 
 
859 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  39.4 
 
 
909 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  40.67 
 
 
873 aa  486  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  37.77 
 
 
881 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  37.77 
 
 
881 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  41.29 
 
 
878 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  36.52 
 
 
897 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  33.86 
 
 
897 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  35.46 
 
 
884 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.05 
 
 
884 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  38.95 
 
 
862 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  38.9 
 
 
879 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  41.6 
 
 
910 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  35.95 
 
 
832 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  41.48 
 
 
908 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  31.79 
 
 
805 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  30.88 
 
 
914 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  32.98 
 
 
834 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  33.25 
 
 
830 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  32.29 
 
 
834 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  31.68 
 
 
850 aa  264  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  30.94 
 
 
883 aa  262  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  31.26 
 
 
867 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  30.85 
 
 
834 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.76 
 
 
904 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  27.22 
 
 
963 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  28.46 
 
 
767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  45.1 
 
 
914 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  34.33 
 
 
894 aa  52  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>