41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3058 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  48.12 
 
 		 834 aa  751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  100 
 
 		 894 aa  1759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  47.35 
 
 		 850 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  46.87 
 
 		 830 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  48.35 
 
 		 834 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  47.64 
 
 		 883 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  41.16 
 
 		 834 aa  495  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  31.08 
 
 		 832 aa  334  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  31.16 
 
 		 909 aa  289  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  31.99 
 
 		 881 aa  284  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  32.1 
 
 		 897 aa  283  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  31.75 
 
 		 881 aa  282  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  30.8 
 
 		 888 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  31.75 
 
 		 851 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  31.6 
 
 		 850 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  34.15 
 
 		 846 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  30.05 
 
 		 884 aa  270  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  30.38 
 
 		 897 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  31.41 
 
 		 884 aa  266  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  32.25 
 
 		 850 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  33.03 
 
 		 862 aa  254  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  30.86 
 
 		 844 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  33.21 
 
 		 878 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  27.73 
 
 		 859 aa  240  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  30.47 
 
 		 914 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  33.91 
 
 		 873 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  30 
 
 		 828 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  33.03 
 
 		 879 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  30.17 
 
 		 908 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  30.03 
 
 		 910 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  29.39 
 
 		 867 aa  210  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  32.4 
 
 		 866 aa  207  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  24.06 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  30.85 
 
 		 914 aa  195  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  27.57 
 
 		 963 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  27.59 
 
 		 904 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  23.97 
 
 		 767 aa  77  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  43.07 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.59 
 
 		 3242 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1005  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1111 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  36.75 
 
 		 3151 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>