37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3861 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  100 
 
 
884 aa  1773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  59.33 
 
 
914 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  92.88 
 
 
897 aa  1575    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  57.71 
 
 
884 aa  931    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  45.77 
 
 
862 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  43.98 
 
 
897 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  44.12 
 
 
881 aa  592  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  43.88 
 
 
881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  35.02 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  37.39 
 
 
846 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  36 
 
 
851 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  35.25 
 
 
844 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  35.86 
 
 
850 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  33.7 
 
 
888 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  34.4 
 
 
828 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  35.99 
 
 
832 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  35.31 
 
 
850 aa  383  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  35.7 
 
 
866 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  34.13 
 
 
873 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  33.26 
 
 
909 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  33.45 
 
 
859 aa  327  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  34.23 
 
 
878 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  34.18 
 
 
879 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  33.23 
 
 
910 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  32.79 
 
 
908 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  30.63 
 
 
834 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  30.7 
 
 
834 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  33.73 
 
 
914 aa  270  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  30.31 
 
 
830 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  31.13 
 
 
883 aa  255  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  31.2 
 
 
850 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  30.02 
 
 
867 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  30.88 
 
 
894 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.24 
 
 
904 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  29.82 
 
 
834 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  28.26 
 
 
963 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  26.42 
 
 
767 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>