38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2956 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  60.05 
 
 
873 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  63.65 
 
 
910 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  63.8 
 
 
908 aa  775    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  100 
 
 
879 aa  1719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  63.84 
 
 
914 aa  755    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  58.61 
 
 
878 aa  829    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  43.27 
 
 
909 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  40.83 
 
 
859 aa  525  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  40.27 
 
 
851 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  39.37 
 
 
846 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  40 
 
 
850 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  38.9 
 
 
844 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  36.97 
 
 
888 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  38.84 
 
 
828 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  39.29 
 
 
850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  38.21 
 
 
866 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  34.52 
 
 
884 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  34.72 
 
 
897 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  34.38 
 
 
862 aa  356  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  33.02 
 
 
881 aa  339  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  32.88 
 
 
884 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  33.22 
 
 
881 aa  336  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  33.79 
 
 
897 aa  333  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  31.73 
 
 
832 aa  330  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  34.38 
 
 
834 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  33.79 
 
 
834 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  34.64 
 
 
830 aa  312  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  31.26 
 
 
914 aa  303  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  27.94 
 
 
805 aa  280  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  31.65 
 
 
867 aa  272  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  31.2 
 
 
850 aa  266  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  32.67 
 
 
883 aa  266  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  30.45 
 
 
834 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  33 
 
 
894 aa  204  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.42 
 
 
904 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  29.72 
 
 
963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  24.94 
 
 
767 aa  115  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  21.09 
 
 
2993 aa  44.7  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>