38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0831 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  72.85 
 
 		 844 aa  1125    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  66.55 
 
 		 888 aa  1101    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  89.2 
 
 		 851 aa  1405    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  77.65 
 
 		 850 aa  1204    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  79.32 
 
 		 850 aa  1234    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 846 aa  1680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  69.53 
 
 		 828 aa  1066    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  47.13 
 
 		 866 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  41.93 
 
 		 873 aa  535  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  42.14 
 
 		 878 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  40.36 
 
 		 859 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  39.61 
 
 		 909 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  38.96 
 
 		 862 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  38.25 
 
 		 881 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  37.69 
 
 		 897 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  38.25 
 
 		 881 aa  485  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  37.37 
 
 		 884 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  37.92 
 
 		 879 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  37.15 
 
 		 884 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  36.84 
 
 		 897 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  44.23 
 
 		 910 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  36.36 
 
 		 832 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  43.05 
 
 		 914 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  31.89 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  33.87 
 
 		 914 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  35.17 
 
 		 834 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  35.15 
 
 		 830 aa  346  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  34.82 
 
 		 834 aa  343  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  31.55 
 
 		 883 aa  282  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  32.58 
 
 		 850 aa  280  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  31.43 
 
 		 867 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  32.8 
 
 		 834 aa  256  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  29.8 
 
 		 904 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  27.88 
 
 		 963 aa  171  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.42 
 
 		 767 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  50.35 
 
 		 908 aa  100  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  37.14 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  19.93 
 
 		 2993 aa  45.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>