37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3378 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  100 
 
 		 963 aa  1862    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  31.2 
 
 		 832 aa  209  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  29.65 
 
 		 862 aa  208  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  28.64 
 
 		 884 aa  205  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  30.32 
 
 		 888 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  28.54 
 
 		 897 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  28.53 
 
 		 884 aa  190  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  29.06 
 
 		 909 aa  189  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  27.68 
 
 		 881 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  27.55 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  30.23 
 
 		 846 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  27.59 
 
 		 881 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  27.83 
 
 		 844 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  27.02 
 
 		 914 aa  173  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  29.62 
 
 		 851 aa  173  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  29.4 
 
 		 850 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  30.19 
 
 		 910 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  29.77 
 
 		 908 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  26.35 
 
 		 850 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  30.37 
 
 		 879 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  28.76 
 
 		 873 aa  155  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  26.86 
 
 		 883 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  27.22 
 
 		 830 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  30.39 
 
 		 828 aa  148  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  29.56 
 
 		 859 aa  146  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  29.46 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  30.44 
 
 		 866 aa  144  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  27.6 
 
 		 834 aa  141  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  30.96 
 
 		 767 aa  138  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  27.66 
 
 		 904 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  27.84 
 
 		 834 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  28.32 
 
 		 834 aa  107  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  26.9 
 
 		 867 aa  99.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  31.07 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  37.63 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  33.54 
 
 		 850 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  30 
 
 		 894 aa  48.9  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>