38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1882 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  44.89 
 
 
888 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  100 
 
 
866 aa  1696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  47.31 
 
 
844 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  46.64 
 
 
846 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  47.48 
 
 
850 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  48.74 
 
 
851 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  46.65 
 
 
828 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  46.35 
 
 
850 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  38.44 
 
 
859 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  39.44 
 
 
873 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  38.24 
 
 
909 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  35.74 
 
 
862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  40.33 
 
 
878 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  35.12 
 
 
897 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  38.07 
 
 
884 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  36.47 
 
 
881 aa  429  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  38.42 
 
 
879 aa  426  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  36.11 
 
 
881 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  36.24 
 
 
897 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  36.3 
 
 
884 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  34.6 
 
 
832 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  39.39 
 
 
910 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  39.06 
 
 
908 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  32.44 
 
 
914 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  39.15 
 
 
914 aa  361  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  31.26 
 
 
805 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  33.18 
 
 
834 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  33.06 
 
 
830 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  32.05 
 
 
850 aa  278  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  32.76 
 
 
834 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  32.51 
 
 
883 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  32.4 
 
 
867 aa  250  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  31.74 
 
 
834 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  32.33 
 
 
894 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  30.09 
 
 
904 aa  180  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  30.1 
 
 
963 aa  163  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  28.67 
 
 
767 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.03 
 
 
2851 aa  44.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>