38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3568 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  57.02 
 
 
884 aa  939    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  92.88 
 
 
884 aa  1589    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  59.75 
 
 
914 aa  941    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  100 
 
 
897 aa  1796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  44.89 
 
 
862 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  43.76 
 
 
897 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  43.39 
 
 
881 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  43.16 
 
 
881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  33.64 
 
 
805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  37.16 
 
 
846 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  35.13 
 
 
851 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  34.86 
 
 
844 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  35.86 
 
 
850 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  33.01 
 
 
888 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  35.53 
 
 
832 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  34.27 
 
 
828 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  35.11 
 
 
850 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  35.43 
 
 
866 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  35.29 
 
 
873 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  33.12 
 
 
909 aa  337  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  32.41 
 
 
859 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  35.33 
 
 
878 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  33.97 
 
 
910 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  33.68 
 
 
908 aa  300  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  33.72 
 
 
879 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  33.72 
 
 
914 aa  283  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  31.53 
 
 
834 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  31.43 
 
 
834 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  30.1 
 
 
830 aa  266  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  30.37 
 
 
883 aa  255  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  29.9 
 
 
867 aa  250  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  30.83 
 
 
850 aa  250  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  31.01 
 
 
894 aa  224  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.49 
 
 
904 aa  208  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  29.55 
 
 
834 aa  208  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  28.21 
 
 
963 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.48 
 
 
767 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf497  massive surface protein MspF  24.28 
 
 
2993 aa  44.3  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.378464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>