37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0480 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  47.09 
 
 
830 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  49.13 
 
 
834 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  49.3 
 
 
834 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  100 
 
 
850 aa  1677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  45.78 
 
 
883 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  47.5 
 
 
894 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  41.29 
 
 
834 aa  499  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  31.09 
 
 
832 aa  300  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  31.62 
 
 
881 aa  289  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  31.38 
 
 
881 aa  283  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  32.47 
 
 
851 aa  281  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  31.09 
 
 
909 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  29.41 
 
 
888 aa  270  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  29.81 
 
 
897 aa  261  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  31.91 
 
 
846 aa  257  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  31.09 
 
 
884 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  32.01 
 
 
873 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  32.3 
 
 
878 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  31.3 
 
 
828 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  29.97 
 
 
862 aa  241  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  31.33 
 
 
844 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  30.09 
 
 
884 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  30.81 
 
 
850 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  29.55 
 
 
897 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  29.74 
 
 
850 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  30.54 
 
 
879 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  29.47 
 
 
859 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  28.13 
 
 
914 aa  220  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  29.94 
 
 
866 aa  217  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  31.29 
 
 
867 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  26.22 
 
 
805 aa  211  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  30.5 
 
 
908 aa  211  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  30.38 
 
 
910 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  30.78 
 
 
914 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  25.98 
 
 
963 aa  137  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  24.12 
 
 
767 aa  73.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  34.73 
 
 
904 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>