37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4021 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  59.54 
 
 		 884 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 914 aa  1840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  60.73 
 
 		 897 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  54.37 
 
 		 884 aa  879    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  41.48 
 
 		 881 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  41.18 
 
 		 881 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  41.6 
 
 		 897 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  43.84 
 
 		 862 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  32.64 
 
 		 805 aa  412  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  30.81 
 
 		 888 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  33.3 
 
 		 844 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  33.74 
 
 		 850 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  32.55 
 
 		 832 aa  359  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  32.19 
 
 		 828 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  34.24 
 
 		 846 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  32.44 
 
 		 850 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  31.51 
 
 		 851 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  31.64 
 
 		 909 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  32.1 
 
 		 873 aa  319  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  31.86 
 
 		 879 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  34.51 
 
 		 866 aa  304  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  30.05 
 
 		 859 aa  292  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  32.55 
 
 		 910 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  32.85 
 
 		 878 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  32.41 
 
 		 908 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  30.34 
 
 		 850 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  29.66 
 
 		 834 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  29.82 
 
 		 834 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  32.5 
 
 		 914 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  29.14 
 
 		 830 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  30.07 
 
 		 883 aa  258  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  29.5 
 
 		 867 aa  234  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  32.45 
 
 		 894 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  28.35 
 
 		 904 aa  217  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  27.27 
 
 		 963 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  28.67 
 
 		 834 aa  175  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  26.77 
 
 		 767 aa  107  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>