37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0232 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0232  hypothetical protein  100 
 
 		 904 aa  1734    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1599  hypothetical protein  30.27 
 
 		 832 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1984  hypothetical protein  27.98 
 
 		 881 aa  233  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3861  hypothetical protein  29.04 
 
 		 884 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2539  hypothetical protein  29.72 
 
 		 884 aa  230  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1909  hypothetical protein  27.64 
 
 		 881 aa  227  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0996  hypothetical protein  27.48 
 
 		 897 aa  221  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3097  hypothetical protein  30.54 
 
 		 862 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1161  hypothetical protein  29.07 
 
 		 888 aa  214  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0100721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0664  hypothetical protein  28.48 
 
 		 844 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.44285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0831  hypothetical protein  29.58 
 
 		 846 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.844423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5221  hypothetical protein  30.01 
 
 		 850 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.954731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4021  hypothetical protein  27.74 
 
 		 914 aa  201  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0730  hypothetical protein  28.09 
 
 		 834 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223584  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0057  hypothetical protein  25.58 
 
 		 805 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0051  hypothetical protein  30.29 
 
 		 859 aa  185  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0480  hypothetical protein  27.93 
 
 		 850 aa  185  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0940  hypothetical protein  28.42 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2385  hypothetical protein  28.32 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0225171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1680  hypothetical protein  31.01 
 
 		 873 aa  179  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4872  hypothetical protein  29.55 
 
 		 850 aa  177  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0573  hypothetical protein  28.63 
 
 		 828 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3815  hypothetical protein  28.4 
 
 		 909 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2449  hypothetical protein  29.31 
 
 		 830 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313088  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1882  hypothetical protein  29.82 
 
 		 866 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3058  conserved hypothetical protein TIGR02302  28.29 
 
 		 894 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.56238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4849  hypothetical protein  30.02 
 
 		 878 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.151765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1706  hypothetical protein  30.06 
 
 		 914 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1537  hypothetical protein  28.49 
 
 		 908 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161966 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3496  hypothetical protein  27.87 
 
 		 883 aa  160  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1817  hypothetical protein  28.51 
 
 		 910 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373268  normal  0.202162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3378  hypothetical protein  27.56 
 
 		 963 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.143577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2372  hypothetical protein  26.74 
 
 		 867 aa  152  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.190188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2956  hypothetical protein  27.75 
 
 		 879 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2019  hypothetical protein  28.53 
 
 		 834 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0867221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0743  hypothetical protein  27.7 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3568  hypothetical protein  33.55 
 
 		 897 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>