More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2064 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2064  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
226 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.189358  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3459  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  96.9 
 
 
226 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3104  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  96.9 
 
 
226 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0660664  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2980  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
223 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.74053  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3460  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
221 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3105  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271299  normal  0.30867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  41.38 
 
 
242 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4023  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.08 
 
 
224 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2065  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
221 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0591  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  31.08 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
226 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0777  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.62 
 
 
218 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554294  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1982  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
262 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
216 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
218 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  34.16 
 
 
216 aa  105  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 
234 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
235 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
235 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
226 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
226 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  33.33 
 
 
226 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0315  putative ABC transporter permease protein  32.84 
 
 
213 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000179875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  33.33 
 
 
232 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
232 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
232 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2776  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
258 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
290 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312704  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  33 
 
 
209 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38830  amino acid ABC transporter membrane protein  32.3 
 
 
269 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.834916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1603  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
260 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0283  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  34.98 
 
 
219 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.416279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
321 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1029  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
216 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
218 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
219 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  0.557505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0238  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.94 
 
 
450 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3697  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuD  35.27 
 
 
220 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.58 
 
 
510 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  32.99 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  32.99 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9352  glutamine ABC transporter, permease protein, putative  33.04 
 
 
282 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  32.99 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1834  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.448047  normal  0.895593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2483  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
254 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000249408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
324 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0211  amino acid ABC transporter, permease  33.69 
 
 
238 aa  99  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  32.04 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  32.47 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.43 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1439  amino acid ABC transporter permease  32.35 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  32.8 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 
516 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5242  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  34.39 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2391  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.86 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3974  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.02 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0905  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.43 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000497514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.02 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.74 
 
 
510 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0245  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.44 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 
217 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.89 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0330968 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
245 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  33.81 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.98 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  38.95 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.02 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.64 
 
 
449 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100929  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0067  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.81 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142036  hitchhiker  0.00708692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.35 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.89 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  31.48 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3263  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 
323 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  33.66 
 
 
230 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.62 
 
 
502 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
591 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>