More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2372 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2372  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2312  uroporphyrin-III C-methyltransferase  86.89 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3186  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.31 
 
 		 249 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.31 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2921  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.9 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.38 
 
 		 490 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2220  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.5 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 		 521 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 		 485 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 		 510 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1526  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.656965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.72 
 
 		 507 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 		 485 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 		 485 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 		 505 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2556  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  45.04 
 
 		 493 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3750  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.75 
 
 		 497 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592413  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1476  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.446834  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2820  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.59 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 		 490 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 		 479 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  44.96 
 
 		 477 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.56 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 		 475 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  43.78 
 
 		 485 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.56 
 
 		 464 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.84 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  40.32 
 
 		 467 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  43.4 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  44.54 
 
 		 478 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.44 
 
 		 463 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 482 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.39 
 
 		 480 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.52 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.88 
 
 		 473 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.44 
 
 		 463 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2965  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.8 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0260792  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.65 
 
 		 464 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.46 
 
 		 481 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.5 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.15 
 
 		 463 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.19 
 
 		 478 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.53 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3770  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.78 
 
 		 300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  39.67 
 
 		 470 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  39.67 
 
 		 473 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  39.67 
 
 		 473 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.98 
 
 		 480 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.63 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.18 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  39.92 
 
 		 465 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.98 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 		 478 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  39.26 
 
 		 464 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.91 
 
 		 273 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.71 
 
 		 493 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  41.15 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  39.5 
 
 		 465 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.77 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  38.33 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  38.62 
 
 		 457 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.83 
 
 		 503 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.32 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  40.09 
 
 		 457 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  40.09 
 
 		 457 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  40.09 
 
 		 457 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.56 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.1 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.5 
 
 		 503 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.92 
 
 		 464 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  40.09 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  40.09 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  43.6 
 
 		 462 aa  159  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.51 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  40.34 
 
 		 457 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  38.31 
 
 		 464 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.89 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.39 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.29 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1718  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.42 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.07 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 		 480 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.1 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>