More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3186 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3186  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2312  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.81 
 
 		 251 aa  344  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.472468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  68.22 
 
 		 255 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2372  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.31 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2921  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.42 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.54 
 
 		 521 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.28 
 
 		 510 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.73 
 
 		 490 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2220  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.14 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.95 
 
 		 507 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 		 505 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1526  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.12 
 
 		 240 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.656965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.81 
 
 		 485 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2556  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.93 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 		 485 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 		 485 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3750  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 497 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592413  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  44.49 
 
 		 493 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.26 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2820  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.54 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.34 
 
 		 490 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1476  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.54 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.446834  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  46.84 
 
 		 477 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.68 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.97 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.85 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  46.41 
 
 		 478 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  43.2 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.79 
 
 		 480 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  42.36 
 
 		 459 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.74 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.29 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  42.36 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  43.98 
 
 		 467 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.84 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.29 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 		 461 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.29 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.29 
 
 		 281 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  44.3 
 
 		 485 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  42.91 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.79 
 
 		 481 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 		 463 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.78 
 
 		 480 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 463 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.15 
 
 		 480 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.84 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 463 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 		 478 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 478 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.04 
 
 		 484 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.95 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.39 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 		 478 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.77 
 
 		 464 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.95 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  41.2 
 
 		 465 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.68 
 
 		 479 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.89 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  46.26 
 
 		 490 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  42.33 
 
 		 473 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  42.33 
 
 		 473 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  42.33 
 
 		 470 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.48 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  45.18 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.77 
 
 		 465 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 		 464 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.91 
 
 		 480 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  41.2 
 
 		 464 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3770  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.69 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.74 
 
 		 493 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.18 
 
 		 491 aa  168  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  41.2 
 
 		 464 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.88 
 
 		 464 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.41 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2965  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.67 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0260792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.5 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.55 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.81 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.41 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.79 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.63 
 
 		 487 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.55 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  41.59 
 
 		 457 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.69 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.22 
 
 		 478 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>