70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1473 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  85.46 
 
 		 282 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  84.95 
 
 		 282 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  71.03 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  74.8 
 
 		 247 aa  347  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  60.55 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  54.66 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  46.85 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  44.53 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  41.22 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  40.56 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  38.67 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  41.13 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  41.77 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  36.59 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  40.98 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  38.4 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  37.36 
 
 		 307 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  44.4 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  37.5 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  42.39 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.5 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  39.92 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  39.18 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  42.13 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  38.98 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.15 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  38.67 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  39.04 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  35.83 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  39.22 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  36.86 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  38.72 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  40.8 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  38.62 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  36.99 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  37.35 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  39.27 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  33.21 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  36.18 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  36.17 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  34.82 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  38.89 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  32.92 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  39.08 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  35.63 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  38.24 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  32.78 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  35.08 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  34.68 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  35.98 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  33.06 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  32.92 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  37.29 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  36.48 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  31.06 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  33.2 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  32.05 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  28.85 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  28.3 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  31.25 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  29.1 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  31.39 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  32.09 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  28.06 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  30.24 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  28.89 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>