59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2731 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  42.37 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  29.76 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  29.05 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  29.61 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  28.63 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  27.1 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  30.17 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.69 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  26.86 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  25.31 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  26.12 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  26.12 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  26.86 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  29.05 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  24.89 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  26.51 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  29.05 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  29.27 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.69 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  27.27 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  26.86 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  25.81 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  27.24 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  25.21 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  25.83 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  27.89 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  24.7 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  27.39 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  30.27 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  27.67 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  24.4 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  24.4 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  26.64 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  29.65 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  22.03 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  23.67 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  25.4 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  25.2 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  26.59 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  27.23 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  26.42 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  24.8 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  25.6 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  27.12 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  25.69 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  24.69 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  25.91 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  25.91 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  25.43 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  25.31 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  22.76 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  23.64 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  24.4 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  25.63 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  25.31 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>