69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0153 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  57.32 
 
 		 307 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  57.89 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  54.66 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  53.44 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  51.82 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  51.43 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  45.87 
 
 		 273 aa  211  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  45.27 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  37.3 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  42.62 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  37.96 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  42.74 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  38.93 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  38.11 
 
 		 287 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  40.89 
 
 		 318 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  39.03 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  39.04 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  37.25 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  37.73 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.77 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  36.61 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.38 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  37.96 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  37.3 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  35.21 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  35.06 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  35.55 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  39.69 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  33.88 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  34.94 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  31.92 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  33.86 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  31.97 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  34.68 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  34.29 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  32.24 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  33.47 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  35.63 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  33.33 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  32.82 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30.71 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  35.66 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  30.74 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  34.33 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  30.4 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  29.32 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  35.37 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  33.61 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  28.85 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  35.5 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30.6 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  32.65 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  30.77 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  32.24 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  31.93 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  30.04 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  28.96 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  32.45 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  29.56 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  30.5 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  25.74 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  31.27 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  30.45 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  25.37 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  24.52 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>