70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4394 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  66.56 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  63.67 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  65.36 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  64.45 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  65.45 
 
 		 298 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  60.13 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  47.64 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  47.79 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  45.52 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  45.98 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  44.73 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  45.69 
 
 		 265 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  46.13 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  48.43 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  50.82 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  49.2 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  47.76 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  45.53 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  42.68 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  39.37 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  36.72 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  38.28 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  36.08 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  36.18 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  37.25 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  35.88 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  35.04 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  34.02 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  33.33 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  32.93 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  31.56 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  31.56 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  31 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  34.3 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  33.85 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  30.94 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  34.44 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  31.08 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  32.35 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  34.39 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  34.51 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  34.3 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  32.23 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  32.96 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  32.59 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  25.49 
 
 		 263 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  29.34 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  31.8 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  32.77 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  33.87 
 
 		 242 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  34.92 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  29.55 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  33.62 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  29.96 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  21.35 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  31.03 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  28.46 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  25.82 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  31.98 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  31.22 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  31.07 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  26.88 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  22.4 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  25.69 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  23.43 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>