69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2976 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  89.15 
 
 		 258 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  59.09 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  56.52 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  53.88 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  52.8 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  39.36 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  46.34 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  42.13 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  43.37 
 
 		 282 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  43.87 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  43.37 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  41.57 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  39.92 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  37.75 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  36.9 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  38.06 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  37.4 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  37.86 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  37.75 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  37.6 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  33.86 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  36.93 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  34.13 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  34.68 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  34.4 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  38.22 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  36.18 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  38.17 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  34.01 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  32.56 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.92 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  31.75 
 
 		 300 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.32 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  36.91 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  34.13 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  32.51 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  36.67 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  35.56 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  36.67 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  35.19 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  35.37 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  35.39 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  31.56 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  30.65 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  35.97 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  29.48 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  34.33 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  31.06 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  36.17 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  31 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  27.87 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  32.62 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  29.1 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  27.95 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  27.07 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  30.36 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  28.46 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  31.07 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  28.68 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  26.55 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  28.74 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  27.78 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  24.21 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  23.92 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>