69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4138 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  90.43 
 
 		 282 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  85.46 
 
 		 282 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  74.45 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  75.61 
 
 		 247 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  62.11 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  53.44 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  45.42 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  44.13 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  40.61 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  38.32 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.76 
 
 		 268 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  39.6 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  39.68 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  36.43 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  38.96 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  44.18 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  41.6 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.36 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  36.76 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  40.96 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  36.5 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  39.75 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  39.36 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  41.7 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  37.96 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  39.04 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  38.65 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  35.88 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  37.85 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  36.11 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  39.22 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  38.46 
 
 		 263 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  38.96 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  35.18 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  35.08 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  36.9 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  37.55 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  36.05 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  34.55 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  34.15 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  38.19 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  37.29 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  35.22 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  37.5 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  36.64 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  37.82 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  31.4 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  35.37 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  35.59 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  34.93 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  36.02 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  32.23 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  33.33 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  34.32 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  30.92 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  33.2 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  29.22 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  30.86 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  32.17 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  29.41 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  32.23 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  28.86 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  29.14 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  30 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  30.63 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  27.8 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>