69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1494 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  60.45 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  62.6 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  56.13 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  57.03 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  51.89 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  52.82 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  52.8 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  48.86 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  53.66 
 
 		 318 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  48.13 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  51.37 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  50.39 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  49 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  49.4 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  48.99 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  47.64 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  46.97 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  44.98 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  42.62 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  40.64 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  37.3 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  38.71 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  39.2 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  38.4 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  39.6 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  37.15 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  37.7 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  37.7 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  35.1 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  36.47 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  31.8 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  37.05 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  33.46 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  31.62 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  35.48 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  32.84 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  34.87 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  32.27 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  32.79 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  31.08 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  36.7 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  29.96 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  35.02 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  31.84 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  30.08 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  32.85 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  27.86 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  36.02 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  29.92 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  35.48 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  29.55 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  31.76 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  30.61 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  34.64 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  30.04 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  31.18 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  30.69 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  29.74 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  27.87 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  32.26 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  29.05 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  31.64 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  25.3 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  27.38 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  24.6 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  27.24 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>