63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3013 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  42.44 
 
 
243 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  30.42 
 
 
307 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  31.47 
 
 
282 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  28.69 
 
 
282 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  29.26 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  28.12 
 
 
282 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  30.61 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  31.31 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  28.88 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  27.24 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  30.2 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  30.22 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  28.15 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  27.54 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  27.78 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  27.07 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  25.19 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  30.12 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  27.17 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  27.08 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  27.39 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  26.43 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  29.46 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  26.19 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.3 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.88 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  26.79 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  30.67 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  25.1 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  25.66 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  26.27 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  25.63 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  25.63 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  21.64 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  26.64 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  23.94 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  24.72 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  27.64 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  26.78 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  26.09 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  21.64 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  20.55 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  23.01 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  28.69 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  24.44 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  22.96 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  24.48 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  27.8 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  26.12 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  25.21 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  25.59 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  26.74 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  24.79 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  25.97 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  23.89 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  27.5 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  27.31 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  24.34 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  26.88 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  26.67 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>