More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3142 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3142  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 486 aa  983    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 		 720 aa  243  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  35.92 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  35.05 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.76 
 
 		 713 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  35.93 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.68 
 
 		 738 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  35.54 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.4 
 
 		 717 aa  226  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  33.4 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  34.5 
 
 		 509 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 		 716 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  33.47 
 
 		 507 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.4 
 
 		 713 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.82 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.67 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.88 
 
 		 705 aa  217  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 		 722 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  34.56 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.51 
 
 		 722 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  33.27 
 
 		 525 aa  213  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.15 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.62 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 		 481 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.47 
 
 		 722 aa  210  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.05 
 
 		 482 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.86 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.9 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.95 
 
 		 712 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.75 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  32.82 
 
 		 716 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.98 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  31.61 
 
 		 510 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.57 
 
 		 515 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.06 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 		 470 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  35.65 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  34.04 
 
 		 505 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  28.17 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  31.83 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.85 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  31.79 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  31.36 
 
 		 513 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.87 
 
 		 704 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.12 
 
 		 717 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.62 
 
 		 467 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.28 
 
 		 484 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.39 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  32.18 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 470 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.2 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.6 
 
 		 546 aa  189  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.05 
 
 		 745 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  28.6 
 
 		 714 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 		 480 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  29.53 
 
 		 464 aa  189  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.83 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.55 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  31.87 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.11 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.68 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  28.48 
 
 		 714 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.33 
 
 		 767 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  27.75 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.66 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.46 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  30.98 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.41 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 		 599 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>