88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1623 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1623  helicase  100 
 
 		 864 aa  1717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2269  helicase  72.47 
 
 		 870 aa  1163    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0574539  hitchhiker  0.0000167796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2884  helicase  38.1 
 
 		 913 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170966  decreased coverage  0.00249571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4537  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1065 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  23.4 
 
 		 912 aa  120  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 775 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  27.46 
 
 		 795 aa  107  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.39 
 
 		 1053 aa  101  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.76 
 
 		 751 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.41 
 
 		 685 aa  93.2  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  18.6 
 
 		 764 aa  90.9  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.83 
 
 		 758 aa  90.9  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.37 
 
 		 804 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.63 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.25 
 
 		 759 aa  87.8  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.9 
 
 		 762 aa  87.4  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.6 
 
 		 897 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  22.27 
 
 		 986 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.87 
 
 		 959 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  20.88 
 
 		 941 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  25.21 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 		 782 aa  84.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.82 
 
 		 807 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.77 
 
 		 752 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  25.73 
 
 		 862 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  22.42 
 
 		 738 aa  82  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  19.9 
 
 		 803 aa  81.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.74 
 
 		 781 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.9 
 
 		 829 aa  80.9  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  23.61 
 
 		 831 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 763 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.07 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  25.78 
 
 		 815 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  24.4 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  22.22 
 
 		 1210 aa  74.7  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.48 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.48 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.6 
 
 		 807 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.48 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  22.3 
 
 		 751 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.35 
 
 		 753 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.92 
 
 		 808 aa  73.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  25.81 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 		 902 aa  70.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  20.96 
 
 		 773 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.73 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 		 807 aa  67.8  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.18 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.23 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  25 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.6 
 
 		 962 aa  65.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  32.43 
 
 		 761 aa  65.1  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.36 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.82 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  26.43 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.31 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.83 
 
 		 766 aa  64.3  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 		 1086 aa  62  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  24.27 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.81 
 
 		 865 aa  58.5  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.75 
 
 		 973 aa  57.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.36 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.82 
 
 		 790 aa  57  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.33 
 
 		 972 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.03 
 
 		 1198 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.37 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  35 
 
 		 804 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.41 
 
 		 896 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  25.48 
 
 		 931 aa  54.7  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 		 789 aa  51.2  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  28.97 
 
 		 948 aa  51.2  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 		 868 aa  51.2  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.05 
 
 		 911 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.14 
 
 		 744 aa  48.5  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.91 
 
 		 812 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.29 
 
 		 761 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.86 
 
 		 803 aa  48.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.5 
 
 		 861 aa  46.6  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 		 879 aa  45.8  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  21.72 
 
 		 905 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>