47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2884 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2884  helicase  100 
 
 
913 aa  1816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170966  decreased coverage  0.00249571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1623  helicase  35.87 
 
 
864 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2269  helicase  35.97 
 
 
870 aa  446  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0574539  hitchhiker  0.0000167796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4537  hypothetical protein  30.1 
 
 
1065 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  23.02 
 
 
912 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0443  hypothetical protein  40.8 
 
 
735 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.88 
 
 
763 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
764 aa  55.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.4 
 
 
775 aa  55.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.81 
 
 
789 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.77 
 
 
790 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
815 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  30.48 
 
 
771 aa  52  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  32.18 
 
 
831 aa  51.6  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.28 
 
 
758 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 
762 aa  51.6  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  29.31 
 
 
761 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  22.48 
 
 
795 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.9 
 
 
861 aa  50.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.28 
 
 
744 aa  50.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  27.83 
 
 
865 aa  49.3  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
959 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
768 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.74 
 
 
790 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.16 
 
 
3409 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 
902 aa  48.5  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
973 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.27 
 
 
804 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  30 
 
 
833 aa  48.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  27.31 
 
 
751 aa  48.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.61 
 
 
868 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  26.52 
 
 
797 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.31 
 
 
812 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
897 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
781 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.27 
 
 
807 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
753 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.12 
 
 
3521 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.92 
 
 
868 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  31.65 
 
 
804 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  28.07 
 
 
905 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.4 
 
 
941 aa  45.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.12 
 
 
807 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  26.92 
 
 
831 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 
764 aa  44.7  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  31.07 
 
 
3692 aa  44.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  22.98 
 
 
758 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>