230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0123 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0123  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 276 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  31.56 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  33.69 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  34.8 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  34.8 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.03 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  30.39 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  31.82 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.11 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.32 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.73 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  32.36 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  35.47 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  35.04 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  34.66 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  34.66 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.07 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.5 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  29.33 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.67 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.34 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.16 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  34.53 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  33.7 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.92 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  32.41 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  34.29 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  31.33 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  27.44 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  29.93 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  32.92 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  29.29 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  33.46 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  32.67 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  30.45 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  29.03 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  30.43 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  31.47 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  32.36 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  29.96 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1176  hypothetical protein  22.96 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.463747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  32.24 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  28.15 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  32.31 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  27.71 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  34.98 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  28.46 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  28.62 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  26.62 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  34.34 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  27.86 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  27.08 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  27.08 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  27.09 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  28.98 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  28.85 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.94 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  26.74 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  28.19 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  30.11 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  29.66 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  28.86 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  28.36 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  28.36 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.28 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  27.73 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  31.88 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  29.74 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  31.14 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  27.99 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.61 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  33.69 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.93 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  28.74 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.63 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.7 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  30.94 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  30.39 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.73 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>