More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2663 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 474 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2335  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  92.75 
 
 		 470 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.179489  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.23 
 
 		 473 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 483 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2663  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 469 aa  949    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2977  transcriptional regulator GntR family  65.78 
 
 		 467 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3062  transcriptional regulator  64.63 
 
 		 460 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  63.54 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  63.58 
 
 		 488 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2948  GntR family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 460 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216869  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2733  GntR family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48160  Aminotransferase protein  65.72 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 459 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0828  GntR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 488 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3723  transcriptional regulator  60.88 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.577094  normal  0.097742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3481  GntR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.679234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4885  GntR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  62.25 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5401  transcriptional regulator  61.57 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0913  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.79 
 
 		 459 aa  571  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7210  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  61.96 
 
 		 478 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4836  GntR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 497 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4735  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.01 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1822  GntR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6290  transcriptional regulator  58.99 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167913  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2063  transcriptional regulator  56.95 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569208  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0258  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4218  aminotransferase class I and II  60.26 
 
 		 471 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.85 
 
 		 464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  55.63 
 
 		 464 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.41 
 
 		 464 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7475  GntR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  41.63 
 
 		 458 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0989  putative transcription regulator protein  41.27 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0613071  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 461 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2507  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.74 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.74 
 
 		 517 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3330  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2266  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 488 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1215  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.87 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2343  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 512 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0860  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1949  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1317  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1004  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.315502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1166  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0288  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1157  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2114  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 489 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.213451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0591  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2542  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0371084  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2384  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2213  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157881  normal  0.27822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0931  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2911  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2037  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3172  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 474 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0954  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5687  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 486 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2369  transcriptional regulator  40 
 
 		 486 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1736  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2348  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2629  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.73 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.73 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0548  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 466 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.1 
 
 		 472 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262075  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4694  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.95 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 494 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.51 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4272  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.51 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200991  normal  0.884881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1834  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.91 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0247  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 482 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0204  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1175  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  36.98 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3668  transcriptional regulator  39 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22591  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4341  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.08 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.86952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0671  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0288  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.97 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1148  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.976845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4469  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4014  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920353  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1109  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3504  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4304  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3072  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4193  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  35.27 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4325  transcriptional regulator GntR  34.08 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4775  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  35.65 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0183  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 474 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214272  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1084  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.190425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1377  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>