78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2143 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  100 
 
 
580 aa  1189    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  50.17 
 
 
580 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  50 
 
 
580 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  48.76 
 
 
563 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  45.86 
 
 
563 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  44.43 
 
 
576 aa  475  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  39.54 
 
 
652 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  40.53 
 
 
415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  40.58 
 
 
415 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  40.34 
 
 
415 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  39.61 
 
 
415 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  39.86 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  39.86 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  39.86 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  39.86 
 
 
415 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  40.91 
 
 
418 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  38.19 
 
 
419 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  33.18 
 
 
431 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  34.19 
 
 
393 aa  191  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  32.77 
 
 
386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  33.18 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  33.18 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  32.72 
 
 
428 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  33.25 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  30.71 
 
 
387 aa  174  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  29.13 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  32.29 
 
 
395 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  31.78 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  31.06 
 
 
386 aa  160  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  26.08 
 
 
415 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  31.96 
 
 
405 aa  157  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  30.68 
 
 
386 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  30.3 
 
 
392 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  29.06 
 
 
401 aa  153  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  30.44 
 
 
394 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  29.23 
 
 
401 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  28.74 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  25.6 
 
 
599 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  30.59 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  28.22 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  26.01 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  40.83 
 
 
149 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  40 
 
 
154 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  43.09 
 
 
152 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  87.4  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  41.23 
 
 
159 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  41.23 
 
 
159 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  47.92 
 
 
166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  40.17 
 
 
131 aa  84  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  23.3 
 
 
422 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  35.48 
 
 
147 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  44.71 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  39.8 
 
 
146 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  33.86 
 
 
150 aa  78.2  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  25.79 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  41.3 
 
 
136 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  34.92 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  26.9 
 
 
368 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  38.14 
 
 
138 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  40.22 
 
 
142 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  25.32 
 
 
380 aa  67  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  38.2 
 
 
137 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  37.11 
 
 
150 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  24.14 
 
 
373 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  28 
 
 
128 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  32.99 
 
 
154 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  30.91 
 
 
154 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  30.91 
 
 
154 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  32.65 
 
 
131 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  26.79 
 
 
120 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  32.65 
 
 
130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  32.65 
 
 
130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  32.65 
 
 
130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  30.93 
 
 
142 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>