35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2555 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  59.82 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  54.62 
 
 
152 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  59.82 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  58.93 
 
 
149 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  59.82 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  59.82 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  58.04 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  61.62 
 
 
166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  49.53 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  36.13 
 
 
563 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.77 
 
 
580 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  33.86 
 
 
580 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  40.77 
 
 
580 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  35.78 
 
 
576 aa  74.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  33.33 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  43.18 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  38.46 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  40.66 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  41.57 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  34.78 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  34.07 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  28.1 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  36.47 
 
 
652 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  34.27 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  34.27 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  34.74 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  32.54 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  35.11 
 
 
116 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  30.93 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  22.22 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  25.51 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>