73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3862 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1126    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  71.04 
 
 		 563 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  48.76 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  50.88 
 
 		 580 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  49.91 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  43.11 
 
 		 576 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  38.42 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  39.23 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  40 
 
 		 415 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  40.81 
 
 		 418 aa  253  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  39.52 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  39.52 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  39.52 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  39.33 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  39.33 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  39.52 
 
 		 415 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  39.04 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  34.46 
 
 		 393 aa  206  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  33.99 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  33.25 
 
 		 386 aa  193  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  34.79 
 
 		 392 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  33.58 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  33.67 
 
 		 387 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  33.58 
 
 		 395 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  28.86 
 
 		 401 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  32.68 
 
 		 405 aa  180  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  29.7 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  29.8 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  32.27 
 
 		 394 aa  174  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  31.47 
 
 		 386 aa  173  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  26.39 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  32.4 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  31.7 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  31.7 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  31.7 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  30.48 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  29.07 
 
 		 384 aa  150  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  26.25 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  31.16 
 
 		 409 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  26.88 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  45.63 
 
 		 155 aa  91.3  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  34.62 
 
 		 149 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  25.68 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  34.62 
 
 		 149 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  34.38 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  75.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  38.38 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  41.24 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  27.46 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.06 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  39.77 
 
 		 137 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  29.96 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  36.17 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  34.74 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  34.74 
 
 		 138 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  36.56 
 
 		 142 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  29.68 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  32.63 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  32.63 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.8 
 
 		 434 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  28.09 
 
 		 126 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  30.93 
 
 		 131 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>