46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4969 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  832    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  35.94 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  33 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  29.9 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  33.5 
 
 
387 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  33 
 
 
401 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  34.8 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  34.78 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  32.24 
 
 
401 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  34.99 
 
 
392 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  35.1 
 
 
392 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  31.22 
 
 
401 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  32.6 
 
 
405 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  32.32 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  31.07 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  31.87 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  31.87 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  31.39 
 
 
393 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  31.97 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  30.64 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  31.75 
 
 
580 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  31.5 
 
 
580 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  28.42 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  30.59 
 
 
580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  26.11 
 
 
384 aa  124  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  28.17 
 
 
599 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  29.23 
 
 
563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  31.16 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  28.13 
 
 
576 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  30.16 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  29.59 
 
 
415 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  29.7 
 
 
415 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  29.76 
 
 
415 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  29.49 
 
 
415 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  29.49 
 
 
415 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  29.49 
 
 
415 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  25.96 
 
 
652 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  33.54 
 
 
418 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  27.79 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  26.68 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  25.21 
 
 
373 aa  86.7  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  25.4 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  28.34 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  25.91 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  23.9 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>