46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3759 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  96.14 
 
 		 415 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  91.57 
 
 		 415 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  99.76 
 
 		 415 aa  840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  92.05 
 
 		 415 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  90.6 
 
 		 415 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  74.22 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  64.99 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  45.8 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  39.86 
 
 		 580 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  41.32 
 
 		 580 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.29 
 
 		 580 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  41.11 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  39.47 
 
 		 563 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  37.5 
 
 		 576 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  34.79 
 
 		 652 aa  223  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  31.21 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  31.95 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  33.89 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  32.85 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  33.09 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  34.15 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  32.68 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  31.78 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  32.38 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  30.94 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  31.54 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  31.54 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  30.93 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  32.85 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  32.44 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  33.41 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  32.44 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  31.55 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  32.66 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  32.85 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  26.96 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  28.42 
 
 		 599 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  29.49 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  27.32 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  26.43 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.82 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  27.53 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  24.56 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  26.65 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>