46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0717 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  100 
 
 
405 aa  826    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  70.56 
 
 
395 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  61.13 
 
 
386 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  55.58 
 
 
392 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  53.05 
 
 
387 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  55.33 
 
 
389 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  53.55 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  50.37 
 
 
394 aa  365  1e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  47.51 
 
 
401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  47.37 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  48.51 
 
 
401 aa  338  8e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  47.19 
 
 
401 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  47.26 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  43.36 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  46.21 
 
 
392 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  39.06 
 
 
393 aa  243  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  34.69 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  33.49 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  32.36 
 
 
580 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  31.73 
 
 
580 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  32.6 
 
 
409 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  30.75 
 
 
563 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  31.76 
 
 
428 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  31.84 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  32.68 
 
 
563 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  31.84 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  34.94 
 
 
415 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  34.15 
 
 
415 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  34.15 
 
 
415 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  33.9 
 
 
415 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  31.14 
 
 
384 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  31.41 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  33.25 
 
 
415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  35.28 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  33.41 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  32.52 
 
 
415 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  32.6 
 
 
415 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  31.96 
 
 
580 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  28.11 
 
 
652 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  29.24 
 
 
576 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  30.31 
 
 
599 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  27.73 
 
 
368 aa  132  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.81 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  27.01 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  25.26 
 
 
380 aa  123  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  30.56 
 
 
422 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>