46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0949 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  100 
 
 
368 aa  746    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  75.14 
 
 
380 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  74.04 
 
 
373 aa  570  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  72.48 
 
 
373 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  38.65 
 
 
391 aa  252  7e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  34.88 
 
 
393 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  32.16 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  29.69 
 
 
415 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  33.71 
 
 
392 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  29.43 
 
 
387 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  29.19 
 
 
389 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  30.46 
 
 
386 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  29.61 
 
 
392 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  32.51 
 
 
401 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  31.53 
 
 
386 aa  143  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  32.43 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  31.96 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  29.95 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  27.73 
 
 
405 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  26.96 
 
 
395 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  27.45 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  29.21 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  24.16 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  27.11 
 
 
415 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  27.76 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  26.18 
 
 
599 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  27.32 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  27.76 
 
 
415 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  26.67 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  26.65 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  25.91 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  26.65 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  27.72 
 
 
563 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  26.65 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  29.7 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  25.84 
 
 
580 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  25.66 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  26.91 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  26.9 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  26.91 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  26.91 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  25.19 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  25.13 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  29.82 
 
 
563 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  25 
 
 
652 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  27 
 
 
576 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>